グラフ関連パッケージ
igraph, tidygraph, sfnetworks の3つのグラフ関連パッケージをまとめて解説
igraph: 低レベルの基本的グラフ構造とアルゴリズムを定義igraphクラスtidygraph: igraphをtidyverseで扱いやすくするラッパーtbl_graphクラス（nodeとedgeを格納した2つのテーブルを合体したオブジェクト）sfnetworks:tidygraphとsfの合体、位置情報を持ったノードとエッジを使える
igraph
グラフのデータ構造とグラフアルゴリズムを定義しているパッケージ。tidygraph, sfnetworksの基盤となっている。
igraphでは：頂点は vertices と表記される
グラフの作成 & 属性の追加
# 3ノードの輪グラフ
g <- igraph::make_ring(3)
# 頂点と辺を確認
#0 列 3 行のデータフレーム
# 行番号は頂点のインデックスになっている
igraph::as_data_frame(g, what = "vertices")
# from to に始点終点のノード番号が格納されている
igraph::as_data_frame(g, what = "edges")
# from to
# 1 1 2
# 2 2 3
# 3 1 3
#頂点に属性nameを付ける
igraph::V(g)$name <- c("A", "B", "C")
# name
# A A
# B B
# C C
#エッジに属性weightを付ける
igraph::E(g)$weight <- c(10, 20, 30)
# from to weight
# 1 A B 10
# 2 B C 20
# 3 A C 30
# グラフの頂点に任意の属性を追加して
igraph::V(g)$hoge <- "hoge"
igraph::E(g)$fuga <- c("A","B","C")
# データフレームに変換してそれを確認
igraph::as_data_frame(g, what = "vertices")
# name hoge
# A A hoge
# B B hoge
# C C hoge
igraph::as_data_frame(g, what = "edges")
# from to weight fuga
# 1 A B 10 A
# 2 B C 20 B
# 3 A C 30 C
グラフ要素へのアクセス
# 頂点名
igraph::V(g)$name
# [1] "A" "B" "C"
# エッジの重み
igraph::E(g)$weight
# [1] 10 20 30
ノードやエッジをデータフレームに変換する
# 頂点とエッジ一覧
igraph::as_data_frame(g, what = "vertices")
igraph::as_data_frame(g, what = "edges")
sfnetworks
R から BigQuery を操作するためのパッケージ
